La organización del Instituto comprende diversas secciones, áreas y programas en los que se desarrollan el grueso de su producción científica y académica. Estos son:

• SECCIONES

Estudios Históricos
Sección en construcción

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Investigaciones Estéticas
Sección en construcción

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Sección Centro de Arqueología Urbana
Director: Dr. Arq. Daniel Schávelzon
CONICET, Investigador Principal – Profesor Titular Interino
Sección que depende de nuestro Instituto, cuenta con varias líneas de investigación en el campo de la arqueología y numerosas excavaciones realizadas en la ciudad de Buenos Aires.

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Sección Archivo Documental
Directora: Arq. Clara Hendlin
CONICET, Profesional Principal – Profesora Adjunta
Sección dedicada al análisis y clasificación de los fondos escritos, gráficos, fotográficos, fílmicos y sónicos que integran el patrimonio del Instituto.Entre este material, destacamos la presencia del Archivo de Estancias Argentinas, con una colección de fotografías originales de diversas estancias del interior argentino. También vale la mención del Archivo de negativos de placas de vidrio del MOP (Ministerio de Obras Públicas), que actualmente cuenta con un programa de recuperación, puesta en valor y difusión.